UMR1309 ASTRE Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes
- Responsable de la structure Nathalie Vachiery +33 (0) 4 67 59 37 68
- Secrétariat
- Adresse Campus International de Baillarguet 34980 MONTFERRIER SUR LEZ
- Téléphone +33 (0) 4 67 59 37 12
- Fax 04 67 59 37 98
- E-mail dominique.martinez [at] cirad.fr
- Site(s) Web http://umr-cmaee.cirad.fr/
- Centre Occitanie-Montpellier
- Département ou direction pilote Santé animale
- Complément d'adresse :
Campus international de Baillarguet TA A15/G 34398 MONTPELLIER CEDEX 5
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Campus international de Baillarguet TA A15/G 34398 MONTPELLIER CEDEX 5
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- Missions :
L'unité développe des recherches sur les maladies animales et zoonotiques d'importance économique et
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L'unité développe des recherches sur les maladies animales et zoonotiques d'importance économique et sanitaire pour les pays du Sud, dont certaines menacent les pays du Nord.
Les recherches sont fondées sur l'étude des interactions entre les micro-organismes pathogènes, les hôtes cibles (domestiques et sauvages) et les vecteurs lorsqu'ils existent en prenant en compte les facteurs d'environnement. Elles visent à décrire et à caractériser les déterminants de l'émergence des agents pathogènes, de leur transmission et de leur diffusion, les processus infectieux mis en oeuvre et la dynamique des populations de vecteurs dans le cas des maladies vectorisées. Les échelles d'analyse s'échelonnent du niveau moléculaire à celui des populations et les recherches combinent des expérimentations en laboratoire et en milieu contrôlé, ainsi que des expérimentations et enquêtes en milieu naturel.
Le projet scientifique est structuré autour de quatre axes :
L'étude de la plasticité des génomes vise à décrire par des approches de génomique (structurale, fonctionnelle, comparée) la diversité génétique des agents pathogènes, son évolution et son impact sur l'adaptation aux changements de milieux. Le développement d'outils de diagnostic et d'épidémiologie moléculaire découle directement de ces études. L'identification de gènes candidats vaccins repose sur l'annotation des génomes complets et les études fonctionnelles.
La réponse des hôtes aux agents pathogènes a pour objectif de caractériser au niveau moléculaire et cellulaire les mécanismes immunitaires qui conduisent à une protection, à une pathologie chronique ou létale afin de développer des vaccins. Ces connaissances permettent la mise au point d'essais d'immunocriblage in vitro des produits de gènes identifiés par les études de génomique, avant le passage à des essais in vivo. Elles permettent également de développer des systèmes de délivrance vaccinaux optimisés.
Les vecteurs en interaction avec les agents pathogènes, les hôtes et l'environnement. La bio-écologie, la dynamique et la génétique des populations de vecteurs, leur dynamique d'infestation par les agents pathogènes et de transmission aux hôtes vertébrés dont ils modulent les réponses inflammatoires et immunitaires font l'objet de recherches renforcées pour mieux comprendre les risques d'émergence et de diffusion.
Observatoires, réseaux sanitaires et cartographie des risques sanitaires. Cet axe intègre les approches disciplinaires des autres axes dans des études d'épidémiologie conduites au sein d'observatoires du vivant (Caraïbes, Océan Indien, Afrique de l'Ouest) pour une caractérisation de la dynamique des maladies et leur modélisation. Les outils développés et les stratégies d'actions élaborées sont mis en oeuvre au sein de réseaux de santé animale et d'observatoires régionaux que l'unité contribue à développer.
L'objectif finalisé du projet est de contribuer à l'évaluation des risques sanitaires et de proposer des méthodes de lutte intégrée mêlant outils et produits issus des biotechnologies (diagnostic, vaccins, thérapeutiques), stratégies et méthodes basées sur la connaissance de l'écologie des vecteurs (lutte anti-vectorielle), des processus épidémiologiques et de leur modélisation.
Les maladies étudiées sont virales telles que la peste bovine et la peste des petits ruminants, les poxviroses des ruminants, la peste porcine africaine, la fièvre catharrale ovine (bluetongue), la fièvre de West Nile, la Fièvre de la vallée du Rift, l'influenza aviaire, ou bactériennes telles que les mycoplasmoses des ruminants (péripneumonie contagieuse bovine, pleuropneumonie contagieuse caprine) ou les ehrlichioses. Certains des agents pathogènes étudiés sont à transmission directe, d'autres sont transmis par les tiques, les culicoides ou les moustiques. Les zones géographiques privilégiées d'intervention sont l'Afrique et la région Caraïbe-Guyanes.
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- Collaborations :
Partenaires académiques : Ecoles Doctorales : CBS2 Université de Montpellier I, Sibaghe Université d
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Partenaires académiques :
Ecoles Doctorales : CBS2 Université de Montpellier I, Sibaghe Université de Montpellier II,
Partenaires Institutionnels
DGAL : Laboratoire National de Référence pour la Fièvre Catarrhale ovine
Réseau Français pour la Santé Animale
OIE
- Laboratoire de référence pour la cowdriose, la peste bovine, la peste des petits ruminants, la péripneumonie contagieuse bovine, la pleuropneumonie contagieuse caprine
- Centre collaborateur pour le diagnostic l'épidémiologie et le contrôle des maladies animales tropicales
FAO
- Centre mondial de référence pour la PPCB (péripneumonie contagieuse bovine),
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et le Moyen Orient pour la PPCC (pleuropneumonie contagieuse caprine),
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et l'Asie pour la peste bovine,
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et l'Asie pour la PPR (peste des petits ruminants).
Centre Régionaux
CIRDES : Centre International de Recherche Développement sur l'Elevage en Zones Sub-humides, Burkina Faso
EISMV : Ecole Inter-états des Sciences et Médecine Vétérinaire de Dakar, Sénégal
ILRI : International Livestock Research Institute, Kenya
Partenaires européens :
PCRD6
REX - EPIZONE
PI - Pharmaplant "Recombinant pharmaceuticals from plants for human health"
Strep - MARKVAC "Development of marker vaccines, companion diagnostic tests and improvement of epidemiological knowledge to facilitate control of rinderpest and peste des petits ruminants viruses"
Strep - EPIGENEVAC "epidemiology and new generation vaccines against Ehrlichia and Anaplasma infections of ruminants"
Strep - RIVERS "Resistance of Influenza Viruses in Environmental Reservoirs and Systems"
Strep - NEWFLUBIRD "Network for early warning of influenza viruses in migratory birds in Europe"
CA - ICTTD3 "International Consortium on ticks and tick-borne diseases"
CA - MedReoNet "Surveillance network of Reoviruses, Bluetongue and African Horse Sickness, in the Mediterranean basin and Europe"
PCRD7
Strep - ASFRISK "Evaluating and controlling the risk of African swine fever in the EU
Strep - PORTFASTFLU "Portable automated test for fast detection and surveillance of influenza"
CSA - ARBOZOONET "International Network for Capacity Building for the Control of Emerging Viral Vector Borne Zoonotic Diseases"
CSSA - DISCONTOOLS "Development of the most effective tools to control infectious animal"
diseases
Partenaires Internationaux
FSP EPIREG « Régionalisation et harmonisation des réseaux d'épidémiosurveillance »
FSP LABOVET "Renforcement de cinq laboratoires de recherche vétérinaire pour le contrôle et la surveillance des maladies animales en Afrique".
FSP GRIPAVI « Ecologie et épidémiologie de la grippe aviaire dans les pays du Sud : amélioration de la surveillance et du contrôle »
Partenaires Industriels
ID-Vet -
BDSL -
Institut Pourquier - IDDEX
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Ecoles Doctorales : CBS2 Université de Montpellier I, Sibaghe Université de Montpellier II,
Partenaires Institutionnels
DGAL : Laboratoire National de Référence pour la Fièvre Catarrhale ovine
Réseau Français pour la Santé Animale
OIE
- Laboratoire de référence pour la cowdriose, la peste bovine, la peste des petits ruminants, la péripneumonie contagieuse bovine, la pleuropneumonie contagieuse caprine
- Centre collaborateur pour le diagnostic l'épidémiologie et le contrôle des maladies animales tropicales
FAO
- Centre mondial de référence pour la PPCB (péripneumonie contagieuse bovine),
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et le Moyen Orient pour la PPCC (pleuropneumonie contagieuse caprine),
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et l'Asie pour la peste bovine,
- Laboratoire régional de référence pour l'Afrique et l'Asie pour la PPR (peste des petits ruminants).
Centre Régionaux
CIRDES : Centre International de Recherche Développement sur l'Elevage en Zones Sub-humides, Burkina Faso
EISMV : Ecole Inter-états des Sciences et Médecine Vétérinaire de Dakar, Sénégal
ILRI : International Livestock Research Institute, Kenya
Partenaires européens :
PCRD6
REX - EPIZONE
PI - Pharmaplant "Recombinant pharmaceuticals from plants for human health"
Strep - MARKVAC "Development of marker vaccines, companion diagnostic tests and improvement of epidemiological knowledge to facilitate control of rinderpest and peste des petits ruminants viruses"
Strep - EPIGENEVAC "epidemiology and new generation vaccines against Ehrlichia and Anaplasma infections of ruminants"
Strep - RIVERS "Resistance of Influenza Viruses in Environmental Reservoirs and Systems"
Strep - NEWFLUBIRD "Network for early warning of influenza viruses in migratory birds in Europe"
CA - ICTTD3 "International Consortium on ticks and tick-borne diseases"
CA - MedReoNet "Surveillance network of Reoviruses, Bluetongue and African Horse Sickness, in the Mediterranean basin and Europe"
PCRD7
Strep - ASFRISK "Evaluating and controlling the risk of African swine fever in the EU
Strep - PORTFASTFLU "Portable automated test for fast detection and surveillance of influenza"
CSA - ARBOZOONET "International Network for Capacity Building for the Control of Emerging Viral Vector Borne Zoonotic Diseases"
CSSA - DISCONTOOLS "Development of the most effective tools to control infectious animal"
diseases
Partenaires Internationaux
FSP EPIREG « Régionalisation et harmonisation des réseaux d'épidémiosurveillance »
FSP LABOVET "Renforcement de cinq laboratoires de recherche vétérinaire pour le contrôle et la surveillance des maladies animales en Afrique".
FSP GRIPAVI « Ecologie et épidémiologie de la grippe aviaire dans les pays du Sud : amélioration de la surveillance et du contrôle »
Partenaires Industriels
ID-Vet -
BDSL -
Institut Pourquier - IDDEX
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