UMR1418 LEM Ecologie Microbienne
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- Responsable de la structure Sylvie NAZARET
- Secrétariat
- Adresse Université Claude Bernard Lyon 1 - Villeurbanne 43 BOULEVARD DU 11 NOVEMBRE 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX
- Téléphone
- Fax
- Site(s) Web https://www.ecologiemicrobiennelyon.fr/
- Centre Lyon-Grenoble-Auvergne-Rhône-Alpes
- Département ou direction pilote Ecologie et biodiversité des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques
- Complément d'adresse :
Laboratoire d'Ecologie microbienne UMR CNRS 5557 - INRAE 1418, Université Lyon1 Campus Lyon Tech-la
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Laboratoire d'Ecologie microbienne
UMR CNRS 5557 - INRAE 1418, Université Lyon1
Campus Lyon Tech-la Doua
Bâtiment Mendel, 5ème étage
16 rue Dubois
69622 Villeurbanne cedex
Réduire- Missions :
Le Laboratoire d’Écologie Microbienne (LEM) est une unité mixte de recherche en cotutelle avec INRAE
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Le Laboratoire d’Écologie Microbienne (LEM) est une unité mixte de recherche en cotutelle avec
INRAE, l’Université Claude Bernard Lyon 1, le CNRS et VetAgro Sup. Elle allie
des compétences en écologie, écologie microbienne, microbiologie pasteurienne,
métabolomique, (méta)génomique, et science du sol.
LEM est un
laboratoire à la confluence entre microbiologie, écologie et environnement, et
les recherches qui y sont menées sont centrées sur les microorganismes :
- Interactions entre les microorganismes et les autres organismes ;
- Relations des microorganismes avec leur environnement ;
- Adaptation des microorganismes aux conditions environnementales et face aux changements globaux.
- Moyens :
Enseignement : L’UMR LEM, avec 29 enseignants-chercheurs et une partie des doctorants assurant des A
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Enseignement : L’UMR LEM, avec 29 enseignants-chercheurs et une partie des
doctorants assurant des Activités Complémentaires en Enseignement, est
fortement impliquée dans les activités d’enseignement et de formation. Environ
6 500 heures de cours sont dispensées chaque année par les agents du LEM dans 4
établissements d’enseignement supérieur : Université Claude Bernard Lyon 1,
Institut Universitaire de Technologie de Lyon, VetAgro Sup et Université Jean
Monnet.
Le LEM pilote ou co-pilote plusieurs formations de
l’Université Claude Bernard Lyon 1 : Licence Sciences du Végétal ; Licence
Pro Microbiologie Industrielle et Biotechnologies ; Licence Pro Analyses
et Techniques d’Inventaire de la Biodiversité ; Master Microbiologie /
Master Biologie Végétale / Master Science du Médicament et des produits de
Santé ; Master (1ère année) Environnement et Risques Industriels et
Urbains.
Infrastructures scientifiques : L’UMR LEM dispose de 5
plateformes/plateaux techniques de recherche, dont trois accessibles aux
partenaires académiques et privés :
- AME : vise à caractériser les activités enzymatiques microbiennes soumises aux interactions biotiques et abiotiques dans tous types d’environnement.
- CESN : est spécialisée dans l’écologie chimique appliquée aux interactions biotiques et abiotiques dans les domaines de l’écologie, l’environnement, et la santé. Elle permet de mener des études globales de métabolomique et également de purifier et identifier des métabolites d’intérêt
- . PARMIC : permet le phénotypage et génotypage de souches bactériennes.
- Collaborations :
Au niveau local : L’UMR préside la fédération de recherche BIOEENVIS et est impliquée dans de nombre
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Au niveau local : L’UMR préside la fédération de recherche BIOEENVIS et est
impliquée dans de nombreux projets collaboratifs avec les laboratoires
rattachés à la FR (RiverLy, Reversaal, EVS, MAP, LBBE, LEHNA). L’UMR participe
aux activités de l’OTHU, de la ZABR, du LabEx IMU, de l’EUR H2O’Lyon, de la
Fondation Rovaltain, et de l’InfectioTron. Ses activités de recherche sont
soutenues par l’Agence de L’eau Rhône-Méditerranée-Corse et la Métropole du
Grand Lyon. L’UMR a également tissé des liens avec des Chambres d’agriculture
et Instituts techniques.
Au niveau national : L’unité collabore avec de nombreux laboratoires, notamment
les unités Ecosys, Agroécologie, IRHS, EcoBio, Opale, BEF et IAM. Les
collaborations nationales mobilisent également plusieurs partenaires privés
(notamment GreenCell, Dipteratech, Amoéba, BayerCropScience). Enfin, l’UMR LEM
est impliquée dans le pilotage du PEPR Solu-Biod (Solutions Fondées sur la
Nature).
Au niveau international : L’UMR coordonne les projets H2020 Biodiversa SupressSOIL, le
projet sino-européen EiCLaR (visant à améliorer la bioremédiation in situ pour
l’assainissement des terres contaminées) et participe au projet H2020
RESTCOAST. Une ERC a récemment été attribuée à une chercheuse du LEM, sur le
thème « Plant and Soil Microbiome Rescue ». L’UMR LEM est également impliquée
dans l’animation du réseau international d’Ecotoxicologie Microbienne,
EcotoxicoMic (adossé à la Fondation Rovaltain).
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