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SA-CT1 : Agents pathogènes : bio-agresseurs (prions, virus, bactéries, parasites, micromycètes) et agresseurs chimiques
(CT)
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Champ 1 - Agents pathogènes : bio-agresseurs (bactéries, virus, parasites, micromycètes, agents non Afficher la suite
Champ 1 - Agents pathogènes : bio-agresseurs (bactéries, virus, parasites, micromycètes, agents non conventionnels transmissibles, autres) et agresseurs chimiques

Ce champ est dédié à la biologie des agents responsables (étiologie) des processus morbides. Les bactéries y sont indiquées car les équipes mixtes de MICA anciennement SA restent au sein des unités de SA et parce que les interactions avec les réponses cellulaires et tissulaires seront étudiées par les équipes SA. Le champ disciplinaire de MICA « Génomique, spéciation, plasticité et acquisition de fonction » correspond au sous champ 1.1. Le champ disciplinaire de MICA « Virulence, mécanisme de la pathogénie » (au sens du micro-organisme) correspond au sous champ 1.2. L'étude de la biologie des autres bio-agresseurs, virus, champignon, EST, parasites peut être décrite dans les sous-champs 1.1, 1.2, 1.3, 1.4. La pharmacologie et la toxicologie trouvent leur place dans ce champ par l'étude des déterminismes de la toxinogenèse (1.5). Enjeux socio-économiques et sanitaires globaux et non par CT Champ 1 - Agents pathogènes : bio-agresseurs (bactéries , virus, parasites, micromycètes, prions, autres) et agresseurs chimiques. Champ dédié à la biologie des agents responsables des processus infectieux et morbides.

1.1 - Génomique des agents pathogènes & déterminants moléculaires de pathogénicité
Connaissance des génomes (recours aux technologies à très haut débit); Diversité génétique des agents ; génomique et populations ou communautés ; Déterminisme génétique de la pathogénicité ; Diversité antigénique ; Adaptation des pathogènes aux hôtes, co-évolutions génétiques ; Connaissance des hôtes ; réservoirs ;
1.2 - Expression des génomes & fonctions
Connaissances « omiques » des agents pathogènes (sauf génomique, 1.1) ; intégration de ces connaissances ; Comportement biologique des pathogènes dans leurs milieux ; influence du milieu sur les pathogènes ; adaptations ; Fluctuations du pouvoir pathogène ;
1.3 - Pathogénicité à l’échelle moléculaire, biologie et chimie structurales
Bases structurales de la pathogénicité ou de l’immunogénicité ; Connaissance structurale des constituants du pathogène (génome, ARN, ARNi, protéines, …..) ; Interactions moléculaires entre constituants du pathogène et constituants de l’hôte (incluant dynamique, modélisation, prédiction d’interactions) ; Pharmacologie ou toxicologie inverse (prédiction basées sur la connaissance structurale de cibles) ; Bases moléculaire et structurale de l’action des agents toxiques ou thérapeutiques ;
1.4 - Applications de la biologie synthétique
Agents pathogènes recombinants ou mosaïques (visées cognitives concernant le pouvoir pathogène, objectifs vaccinaux) ; Protéines et protéines recombinantes ou mosaïques à visée diagnostique ou vaccinale ; Stratégies vaccinales novatrices (vaccins DIVA, vaccins ADN, …) ; Stratégies de diagnostic biologique ; développement d’outils du diagnostic ; Thérapie génique ou cellulaire

1.5 - Déterminisme moléculaire et cellulaire des dangers toxiques
Toxinogénèse,
Mécanismes contrôlant la formation, le transport ou le métabolisme de toxines biologiques ;
Bases moléculaires et cellulaires de la biodisponibilité et de l’action des molécules toxiques (contaminants, perturbateurs endocriniens ou métaboliques, ……) UMR : 12
UR : 4
USC : 3
UE : 3 INRA en ETP : 61 : environ 70 scientifiques et ingénieurs
non INRA en ETP: 47 : environ 100 scientifiques, ingénieurs et enseignants chercheurs Direction Générale de l'Enseignement et de la Recherche : Ecoles Nationales Vétérinaires de Alfort, Lyon, Nantes et Toulouse
Agence Française de la Sécurité Sanitaire des Aliments
CIRAD - Elevage et Médecine Vétérinaire
Office International des Epizooties
Institut Pasteur
Universités
INSERM, Hopitaux
Organismes partenaires européens Acteurs des filières de production et de transformation
DGAL et gestionnaires du risque
Acteurs industriels du domaine des vaccins, médicaments et diagnostic de la SA et SPV Réduire

- Champs de rattachement :
 

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